Ces oiseaux créent leur nid dans des cavités creuses d’arbres, lorsqu’il n’y en a pas de disponible les aras militaires peuvent nicher dans des cavités de falaises karstiques (structure résultant de l’érosion de toutes roches solubles). Une exigence sur la construction du nid est que celui-ci doit avoir une hauteur supérieure à 50 cm s’il se trouve dans un arbre.
Les aras militaires sont monogames et forment des couples à vie mais ont aussi été observé en grande communauté de plus de 50 individus, avec de nombreux autres couples. Comme chez les primates, les couples passent beaucoup de temps à se toiletter. Ainsi ils renforcent leurs liens conjugaux mais évitent surtout l’accumulation de parasites pouvant créer des problèmes de peau par exemple.
Ce sont des reproducteurs saisonniers mais ils peuvent se reproduire tout au long de l’année, cela va dépendre de plusieurs critères comme : la disponibilité des ressources et des cavités, des liens existants entre les deux individus, ou encore de leur localisation. En effet, il a été noté que les aras vivants dans des régions différentes du Mexique avaient des périodes de reproduction différentes.
Dans la période de pré-fécondation, les mâles protègent et nourrissent les femelles. La femelle pond en moyenne 2 à 3 oeufs en une seule couvée. Pendant la période de pré-éclosion, l’approvisionnement et la protection des oeufs sont assurés par les deux sexes. Les mâles continuent de protéger et de nourrir les femelles pendant qu’elles couvent leurs oeufs. Le temps d’éclosion est en moyenne de 26 jours et les nouveau-nés pèsent de 18 à 25 g. A la naissance, les oisillons sont dépendants des deux parents. Leur temps d’envol est en moyenne de 13 semaines et ils quittent le nid pour prendre leur indépendance entre 3 et 5 mois. Dans les périodes de pré-sevrage, d’envol et de pré-indépendance, les deux sexes nourrissent et protègent les jeunes. L’âge de la maturité sexuelle chez les aras militaires est le même pour les deux sexes : 2 à 4 ans. Les aras militaires héritent généralement du territoire de leurs parents.